緑藻
緑藻植物門 CHLOROPHYTA Pascher, 1914
258種 1亜種 5変種 11品種（所蔵標本 156種 3変種 6品種）
緑藻綱 CHLOROPHYCEAE Wille in Warming, 1884＊1
トレボウクシア藻綱 TREBOUXIOPHYCEAE Friedl, 1995
アオサ藻綱 ULVOPHYCEAE Mattox et K.D. Stewart in K.D. Stewart et Mattox, 1978＊2
所属不明 Incertae sedis
車軸藻植物門 CHAROPHYTA Cavalier-Smith
1種（所蔵標本 1種）
車軸藻綱 CHAROPHYCEAE Rabenhorst, 1863
 本リストは，吉田・吉永 (2010) を基に北山・鈴木が改変したものです (2015.3.31)。主な変更点は番号をつけ，リストのあとに列記しました。吉田・鈴木・吉永 (2015) を参考に修正を行いました (2017.12.24)。
＊1 日本の海産多細胞緑藻綱の内，カエトフォラ目（Chaetophorales）に含まれていた属は，Internoretia属を除いてアオサ藻綱（Ulvophyceae）のアオサ目（Ulvales）に移りました。Interenoretia属はO'Kelly (1983)によると，褐藻類のシオミドロ科（Ectocarpaceae）の1種となることから，現在のところ，日本には海産のカエトフォラ目は知られていないようです。また，タマミドリ目（Chlorococcales）に含まれていたハロクロロコックム属（Halochrorococcum）は，アオサ藻綱のヒビミドロ目（Ulotrichales）に移りました。従って現在，日本産種については，海産の多細胞緑藻綱の報告がありません。
＊2 van den Hoek et al. (1995) は，アオサ藻綱（Ulvophyceae sensu lato）を5綱（Bryopsidophyceae, Cladopholophyceae, Dasycladophyceae, Trentepohliophyceae, Ulvophyceae sensu stricto）に分けましたが，Proeschold & Leliaert (2007) に従い、アオサ藻綱1綱としました。
＊3 Brodie et al. (2007) に従い，モツレグサ目（Acrosiphonales）をヒビミドロ目（Ulotrichales）に含みました。
＊4Brodie et al. (2007) 等に従い，ネジレミドリ目（Phaeophilales）をアオサ目（Ulvales）に含みました。
＊5 Leliaert et al. (2012) などに従い,ミドリゲ（クダネダシグサ）目（Siphonocladales）をシオグサ目（Cladophorales)に含みました。
＊6 Brodie et al. (2007) に従い，イワヅタ目（Caulerpales）とミル目（Codiales）をハネモ目（Bryopsidales）に含みました。
＊7 Zechman et al. (2010)は，パルモフィルム科（Palmophyllaceae）とパルモフィルム目（Palmophyllales）を設立し，パルモフィルム属（Palmophyllum）とVerdigellas属をヨツメモ目（Tetrasporales），パルメロプシス科（Palmelopsidaceae）から区別しました。系統解析の結果から，パルモフィルム目，プラシノ藻類，緑藻植物門，ストレプト植物類の関係は明らかにならなかったため，パルモフィルム目の門や綱の所属は不確定です。本リストではパルモフィルム目を便宜上，緑藻植物門の中の所属不明としました。
【引用文献】
Brodie, J., Maggs, C.A. & John, D.M. 2007. Green seaweeds of Britain and Ireland. 242 pp. London: British Phycological Society.
Guiry, M.D. & Guiry, G.M. 2013. AlgaeBase. World-wide electronic publication, National University of Ireland, Galway. http://www.algaebase.org; searched on 20 December 2013.
Leliaert, F., De Clerck, O., Verbruggen, H., Boedeker, C. & Coppejans, E. 2007. Molecular phylogeny of the Siphonocladales (Chlorophyta: Cladophorophyceae). Molecular Phylogenetics and Evolution 44: 1237-1256.
Leliaert, F., Smith, D.R., Moreau, H., Herron, M.D., Verbruggen, H., Delwiche, C.F. & De Clerck, O. 2012. Phylogeny and Molecular Evolution of the Green Algae. Critical Reviews in Plant Sciences 31: 1-46.
O' Kelly, C. J. 1983, Observations on marine Chaetophoraceae (Chlorophyta) IV. The structure, reproduction, and life history of Acrochaete geniculata (Gardner) comb. nov. Phycologia 22: 13-21.
Proeschold, T. & Leliaert, F. 2007. Systematics of the green algae: conflict of classic and modern approaches. In: Brodie, J. & Lewis, J. eds. Unravelling the algae the past, present, and future of algal systematics 376 pp. CRC Press, Florida.
Tokida, J. & Masaki, T. 1959. A list of marine algae collected in the vicinity of Oshoro Marine Biological Station, at Oshoro, Hokkaido, Japan. Bulletin of the Faculty of Fisheries, Hokkaido University 10: 173-195.
van den Hoek, C., Mann, D.G. & Jahns, H.M. 1995. Algae. An Introduction to Phycology. Cambridge University Press, Cambridge.
吉田忠生・鈴木雅大・吉永一男 2015. 日本産海藻目録（2015年改訂版）. 藻類 63: 129-189.
吉田忠生・吉永一男 2010. 日本産海藻目録（2010年改訂版）. 藻類 58 :69-122.
Zechman, F.W., Verbruggen, H., Leliaert, F., Ashworth, M., Buchheim, M.A., Fawley, M.W., Spalding, H., Pueschel, C.M., Buchheim, J.A., Verghese, B. and Hanisak, M.D. 2010. An unrecognized ancient lineage of green plants persists in deep marine waters. Journal of Phycology 46: 1288-1295.
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